尼泊金乙酯和苯甲酸钠是两种常见的化学物质，它们在化学结构和用途上有着显著的区别。

首先，尼泊金乙酯，又称乙酰对氨基苯甲酸乙酯，其化学式为C10H12NO2，是一种有机化合物。它常用作食品防腐剂、医药中间体和塑料添加剂等。尼泊金乙酯无色或微黄色液体，具有芳香味，易溶于有机溶剂，不溶于水。它具有一定的毒性，因此在使用时需要注意安全。

相比之下，苯甲酸钠，化学式为C7H5NaO2，是一种无机化合物。它通常用作食品添加剂、药剂和防腐剂等。苯甲酸钠是一种白色粉末，易溶于水和醇类溶剂，不溶于有机溶剂。它具有较小的毒性，但仍需谨慎使用。

从化学结构上来说，尼泊金乙酯的分子中含有酯基和苯环，而苯甲酸钠的分子中则含有苯环和羧酸根离子。这是两者在使用时的主要区别，也决定了它们的化学性质和应用范围。

综上所述，尼泊金乙酯和苯甲酸钠虽然都是常见的化学物质，但它们在化学结构和用途上有着明显的差异。在使用时，需要根据实际需要选择合适的化学物质，并注意相关的安全事项。