甲基睾丸素和甲睾酮是两种不同的性激素，它们在结构和功能上略有不同。

首先，它们的分子结构不同。甲基睾丸素是一种含有甲基基团的睾酮衍生物，而甲睾酮是一种含有甲基基团和顺式二烯基团的睾酮衍生物。这两种分子的不同基团会影响它们的生物活性和代谢途径。

其次，它们的生物活性不同。甲基睾丸素相对于睾酮来说具有更强的雄性化作用，如促进男性第二性征的发育、增强性欲和提高肌肉质量等。而甲睾酮则具有更强的代谢稳定性和更强的雄激素效应。

此外，它们的代谢途径也有所不同。甲基睾丸素主要通过肝脏代谢，其中一部分会被转化为甲睾酮，而甲睾酮则主要由肾上腺素酶代谢成为睾酮。

综合来看，虽然甲基睾丸素和甲睾酮都是雄性激素，但它们在分子结构、生物活性和代谢途径等方面存在一定的差异。因此，在临床应用时需要根据患者的具体情况和需要进行选择。