安普霉素和新霉素都是广谱抗生素，可用于治疗多种细菌感染。但是它们在化学结构和作用机制上存在一些不同。

首先，安普霉素属于氨基糖苷类抗生素，而新霉素属于多肽类抗生素。这意味着它们的分子结构不同，因此它们对不同类型的细菌具有不同的作用。

其次，安普霉素主要通过阻止细菌蛋白质的合成来杀死细菌。而新霉素则主要通过破坏细菌细胞膜的完整性来杀死细菌。

此外，这两种抗生素的使用方式也有所不同。安普霉素通常通过注射给药，而新霉素则可以口服或注射给药。

最后，安普霉素的副作用可能包括肾脏毒性和听力损失等问题。而新霉素的副作用可能包括胃肠道不适和过敏反应等问题。

总的来说，安普霉素和新霉素是两种不同类型的抗生素，它们在分子结构、作用机制和使用方式上存在差异。在使用这些药物时，应该根据细菌感染的类型和患者的具体情况选择合适的药物。