L5甲基四氢叶酸钙和6S5甲基四氢叶酸钙是两种常见的叶酸衍生物，它们在化学结构上有所不同，因此在药理学和生物学方面也存在一些区别。

首先，L5甲基四氢叶酸钙和6S5甲基四氢叶酸钙的区别在于它们的化学结构中的一个手性中心，即在6位碳原子上的氢原子的取代基。在L5甲基四氢叶酸钙中，这个氢原子的取代基是L型的，而在6S5甲基四氢叶酸钙中，这个取代基是S型的。这个区别可能看起来微不足道，但它却会影响到这两种叶酸衍生物的生物活性和药理学特性。

其次，L5甲基四氢叶酸钙和6S5甲基四氢叶酸钙在人体内的代谢和生物利用方面也有所不同。L5甲基四氢叶酸钙是人体内的活性形式，它可以直接被细胞利用，并且在代谢过程中不需要进行转化。而6S5甲基四氢叶酸钙则需要在体内经过转化才能被利用，因此其生物利用率相对较低。

最后，这两种叶酸衍生物在药理学上的应用也有所不同。L5甲基四氢叶酸钙被广泛应用于预防和治疗缺乏叶酸的疾病，如巨细胞贫血和神经管缺陷。而6S5甲基四氢叶酸钙则被用于治疗一些与叶酸代谢有关的疾病，如铁粒干细胞增多症和白血病。

综上所述，L5甲基四氢叶酸钙和6S5甲基四氢叶酸钙虽然在化学结构上仅有微小差别，但在生物学和药理学方面却存在着明显的差异，因此在实际应用中需要根据具体情况选择合适的叶酸衍生物。