端羟基聚丁二烯和聚异丁烯都是常见的合成橡胶材料，但它们在结构、性质和用途方面存在一些差异。

首先，它们的化学结构不同。端羟基聚丁二烯是由丁二烯单体聚合而成，其中每个聚合物链的末端都有一个端羟基官能团。而聚异丁烯则是由异戊二烯单体聚合而成。

其次，它们的物理和化学性质也有所不同。端羟基聚丁二烯具有良好的弹性、耐磨性和耐寒性，适用于制造轮胎、密封件、管道等。同时，它还具有良好的黏附性和亲水性，容易与其他物质结合。而聚异丁烯则具有较高的化学稳定性和耐热性，适用于制造电缆绝缘材料、自粘胶带等。

最后，它们的应用领域也有所不同。端羟基聚丁二烯主要应用于汽车行业和建筑行业，而聚异丁烯则更多地应用于电子行业和医疗行业。

总之，端羟基聚丁二烯和聚异丁烯虽然都属于橡胶材料，但它们在结构、性质和用途方面存在一些差异。了解它们的区别，有助于我们更好地选择和应用这些材料。