短链氯化石蜡和氯化石蜡在化学结构上有所不同，因此它们的性质和用途也不完全相同。

首先，短链氯化石蜡的分子量比氯化石蜡小，通常在300到600之间。这使得短链氯化石蜡在润滑、防水、防腐等方面具有优异的性能，同时也更易于处理和加工。而氯化石蜡的分子量较大，通常在1000以上，因此更适合用于制造高温润滑油、油漆、塑料等。

其次，短链氯化石蜡的氯含量较高，达到60%以上，因此具有较强的耐水、耐酸、耐碱等化学性质。氯化石蜡的氯含量相对较低，通常在40%左右，但它的热稳定性和抗氧化性能更好，因此更适合用于制造高温润滑油和防腐涂料。

另外，短链氯化石蜡和氯化石蜡在应用领域上也有所不同。短链氯化石蜡主要用于制造防水涂料、油墨、润滑脂等，而氯化石蜡主要用于制造高温润滑油、防腐涂料、聚氯乙烯等。

综上所述，短链氯化石蜡和氯化石蜡在化学结构、性质和用途上都有所不同，因此在实际应用中需要根据具体需求选择适合的产品。