2-氯-4,6-二甲氧基嘧啶是一种重要的有机化合物，具有广泛的应用价值。其合成方法有多种，以下介绍一种简单有效的合成工艺。

首先，将2-氯-4,6-二甲氧基吡啶和氢氧化钠溶液反应，得到2-氯-4,6-二甲氧基吡啶酚。反应条件为在室温下搅拌反应30分钟，产物经水洗后干燥得到。

其次，将2-氯-4,6-二甲氧基吡啶酚和异氰酸甲酯在氯化钠存在下反应，得到2-氯-4,6-二甲氧基嘧啶。反应条件为在80℃下搅拌反应2小时，产物经水洗后干燥得到。

该工艺简单、操作方便、产率高，可大规模应用于2-氯-4,6-二甲氧基嘧啶的工业生产。