活性硅和二氧化硅都是无机化合物，它们在化学结构上有很大的不同。

首先，活性硅是由一些具有硅氧化学键的化合物组成，这些化合物会在一定的温度和压力下发生化学反应，形成了具有大量孔隙和活性表面的硅材料。这些孔隙和活性表面可以吸附和催化许多化学反应，因此活性硅被广泛应用于催化剂、吸附剂、分离剂等领域。

相比之下，二氧化硅则是由硅和氧两种元素组成的化合物，它的化学结构非常简单，通常呈现为无色透明的晶体或粉末。二氧化硅的主要特点是具有良好的绝缘性能和耐高温性能，因此被广泛应用于电子、建筑、玻璃等行业。

此外，活性硅和二氧化硅的物理性质也有很大的不同。活性硅通常呈现为黑色或灰色的颗粒状物质，而二氧化硅则是无色透明的晶体或粉末。活性硅的密度比二氧化硅高，而且具有很强的吸附性能，可以吸附许多有害物质。而二氧化硅的密度则比较低，具有优异的光学性能和化学稳定性。

总之，活性硅和二氧化硅虽然都是由硅元素组成的化合物，但是它们的化学结构、物理性质和应用领域都有很大的不同。在实际应用中需要根据具体的需求选择合适的材料。